>>28230

>пути быстрого сравнения

Так для сравнения тебе придётся секвенировать геном и той и этой. "Есть бактерия из изученных" - это значит её геном проанализирован и имеются записи.
Косвенные методы сравнения все неточные. Вопрос в том, какая нужна точность анализа?

>>28245
А неточный метод может дать знать, между какими сегментами секвенировать? Если может, то ПЦР-ом получится вырезать определённую часть и секвенировать её, профит. Интересуют именно такие методы.

В качестве практического примера (хотя я его просто выдумал), e.coli, где-то введён синтез green fluorescent protein'a, где - примем, как то, что нужно найти. И есть оригинал, без такого синтеза. Возможно-ли с понять, не изучая список векторов, которыми ввели оный?

Кроме того, какие методы хоть как-то эффективны после цепочки из нескольких подобных изменений?

Не подскажешь хорошей литературы?

P.S.: насколько правдива эта статья? http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/anie.201100535/abstract;jsessionid=2A7A467CB5C65BDC348F60AD7D5C69B0.d03t02
P.P.S.: как у e.coli с сохранением своего генетического кода? Тут в статье выше она изображена, как очень быстро изменяющаяся, получается, это сводит подход, который я ищу на нет?

>>28254
Честно говоря, не понял, что ты хочешь. Очень сумбурно пишешь. Приведи корректно записанные условия задачи.
Вообще для фиксации изменений в геноме проще секвенировать его весь заново, чем пытаться предсказать, какие изменения произошли, если мы сделали то и это, например.

>>28261
Вроде уже разобрался, спасибо. :3

Чего-то я такое видал на тему "сажаем резаную ДНК из одного генома крепко на носитель, потом режем второй и все, что не прилипло, анализируем", но ссылку не дам. А полностью ресеквенировать - это ж ебануться сколько стоит и труда съест.
И да, сформулируй почетче. Знать, куда конкретно ген лег, в случае прокариотического генома не так уж важно, если он вменяемо экспрессируется. А разница в экспрессии и по транскриптомам видна, и по РНК-эррэям, и иммуноферментно и вообще по фенотипу.

>>28351
Что? Къ вашаму свiьденiю, связи образуются и съ помощiю инцеста типа (Аминъ Нольодноводородовичъ Мiазинопуринодвазотовъ)=(Аминъ Двасоднимводородовичъ Мiазиназотопуринодвазотогидровъ). А ежели съ двухъ концовъ отрiьзка куски слиплися, то тогды енту разницу ты въ жизнь не найдешь?
Прокофiй

>>28373
Температура плавления зависит от степени комплементарности последовательностей, по ней и сортируют.